Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek9Q8K1R7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nek9Q8K1R7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek9Q8K1R7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms