Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX6

Clec4a3, C-type lectin domain family 4, member a3, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a3Q8JZX6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clec4a3Q8JZX6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clec4a3Q8JZX6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clec4a3Q8JZX6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec4a3Q8JZX6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec4a3Q8JZX6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec4a3Q8JZX6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec4a3Q8JZX6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms