Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF9

Ago3, Protein argonaute-3, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago3Q8CJF9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ago3Q8CJF9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ago3Q8CJF9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ago3Q8CJF9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ago3Q8CJF9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ago3Q8CJF9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ago3Q8CJF9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ago3Q8CJF9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ago3Q8CJF9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ago3Q8CJF9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ago3Q8CJF9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ago3Q8CJF9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ago3Q8CJF9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ago3Q8CJF9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ago3Q8CJF9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ago3Q8CJF9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ago3Q8CJF9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ago3Q8CJF9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ago3Q8CJF9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ago3Q8CJF9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ago3Q8CJF9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ago3Q8CJF9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ago3Q8CJF9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms