Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LgsnQ8CIX8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LgsnQ8CIX8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms