Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cog3Q8CI04 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog3Q8CI04 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms