Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT0

Aldh4a1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh4a1Q8CHT0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aldh4a1Q8CHT0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aldh4a1Q8CHT0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aldh4a1Q8CHT0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aldh4a1Q8CHT0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aldh4a1Q8CHT0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Aldh4a1Q8CHT0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh4a1Q8CHT0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms