Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rab11fip3Q8CHD8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab11fip3Q8CHD8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rab11fip3Q8CHD8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
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