Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV2

Tph2, Tryptophan 5-hydroxylase 2, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph2Q8CGV2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tph2Q8CGV2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tph2Q8CGV2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tph2Q8CGV2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms