Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Brf1Q8CFK2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brf1Q8CFK2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brf1Q8CFK2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
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