Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc73Q8CDM4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc73Q8CDM4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc73Q8CDM4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms