Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc87Q8CDL9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc87Q8CDL9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc87Q8CDL9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms