Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc27Q8CD92 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc27Q8CD92 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ttc27Q8CD92 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc27Q8CD92 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc27Q8CD92 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc27Q8CD92 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc27Q8CD92 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc27Q8CD92 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms