Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8CD60 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8CD60 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8CD60 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8CD60 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8CD60 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8CD60 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8CD60 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8CD60 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q8CD60 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8CD60 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8CD60 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8CD60 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8CD60 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8CD60 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8CD60 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8CD60 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8CD60 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8CD60 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8CD60 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8CD60 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8CD60 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8CD60 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8CD60 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8CD60 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8CD60 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8CD60 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8CD60 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8CD60 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8CD60 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8CD60 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8CD60 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8CD60 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8CD60 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8CD60 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8CD60 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8CD60 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8CD60 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8CD60 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8CD60 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8CD60 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8CD60 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8CD60 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8CD60 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8CD60 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8CD60 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8CD60 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8CD60 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8CD60 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8CD60 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8CD60 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8CD60 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8CD60 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8CD60 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8CD60 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8CD60 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q8CD60 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q8CD60 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8CD60 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8CD60 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8CD60 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8CD60 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8CD60 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8CD60 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8CD60 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8CD60 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8CD60 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8CD60 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8CD60 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8CD60 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8CD60 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8CD60 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8CD60 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8CD60 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8CD60 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8CD60 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8CD60 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8CD60 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8CD60 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8CD60 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8CD60 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8CD60 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8CD60 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8CD60 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8CD60 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8CD60 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CD60 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CD60 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CD60 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CD60 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8CD60 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CD60 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CD60 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CD60 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CD60 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CD60 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CD60 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q8CD60 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q8CD60 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8CD60 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms