Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Riox2Q8CD15 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Riox2Q8CD15 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Riox2Q8CD15 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riox2Q8CD15 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riox2Q8CD15 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riox2Q8CD15 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riox2Q8CD15 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riox2Q8CD15 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riox2Q8CD15 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riox2Q8CD15 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riox2Q8CD15 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riox2Q8CD15 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riox2Q8CD15 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Riox2Q8CD15 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms