Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrip1Q8CBD1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nrip1Q8CBD1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrip1Q8CBD1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms