Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slfn5Q8CBA2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn5Q8CBA2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slfn5Q8CBA2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms