Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Podxl2Q8CAE9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Podxl2Q8CAE9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Podxl2Q8CAE9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Podxl2Q8CAE9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Podxl2Q8CAE9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Podxl2Q8CAE9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Podxl2Q8CAE9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Podxl2Q8CAE9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Podxl2Q8CAE9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Podxl2Q8CAE9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Podxl2Q8CAE9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Podxl2Q8CAE9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Podxl2Q8CAE9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Podxl2Q8CAE9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Podxl2Q8CAE9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Podxl2Q8CAE9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Podxl2Q8CAE9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Podxl2Q8CAE9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Podxl2Q8CAE9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Podxl2Q8CAE9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Podxl2Q8CAE9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Podxl2Q8CAE9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Podxl2Q8CAE9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Podxl2Q8CAE9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Podxl2Q8CAE9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms