Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A430089I19RikQ8C9W1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A430089I19RikQ8C9W1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
A430089I19RikQ8C9W1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms