Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tsr2Q8C8T8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tsr2Q8C8T8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms