Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp20Q8C6M1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp20Q8C6M1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp20Q8C6M1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
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