Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6B2

Rtkn, Rhotekin, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtknQ8C6B2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RtknQ8C6B2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RtknQ8C6B2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RtknQ8C6B2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RtknQ8C6B2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RtknQ8C6B2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RtknQ8C6B2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RtknQ8C6B2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RtknQ8C6B2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RtknQ8C6B2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RtknQ8C6B2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RtknQ8C6B2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RtknQ8C6B2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RtknQ8C6B2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RtknQ8C6B2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RtknQ8C6B2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RtknQ8C6B2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RtknQ8C6B2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RtknQ8C6B2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms