Protein–RNA interactions for Protein: Q8C176

Taf2, Transcription initiation factor TFIID subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf2Q8C176 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf2Q8C176 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf2Q8C176 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf2Q8C176 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf2Q8C176 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf2Q8C176 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf2Q8C176 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf2Q8C176 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf2Q8C176 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf2Q8C176 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf2Q8C176 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf2Q8C176 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf2Q8C176 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf2Q8C176 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf2Q8C176 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Taf2Q8C176 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf2Q8C176 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Taf2Q8C176 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf2Q8C176 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf2Q8C176 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms