Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg16l1Q8C0J2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms