Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TnrQ8BYI9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TnrQ8BYI9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms