Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc169Q8BXX9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc169Q8BXX9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms