Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube3dQ8BX13 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube3dQ8BX13 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms