Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVQ5

Ppme1, Protein phosphatase methylesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppme1Q8BVQ5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppme1Q8BVQ5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppme1Q8BVQ5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppme1Q8BVQ5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppme1Q8BVQ5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ppme1Q8BVQ5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppme1Q8BVQ5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppme1Q8BVQ5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppme1Q8BVQ5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppme1Q8BVQ5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppme1Q8BVQ5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppme1Q8BVQ5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppme1Q8BVQ5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppme1Q8BVQ5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppme1Q8BVQ5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppme1Q8BVQ5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppme1Q8BVQ5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppme1Q8BVQ5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppme1Q8BVQ5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppme1Q8BVQ5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppme1Q8BVQ5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppme1Q8BVQ5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppme1Q8BVQ5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms