Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Triml1Q8BVP1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Triml1Q8BVP1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Triml1Q8BVP1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 387.4 ms