Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY8

Scfd2, Sec1 family domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scfd2Q8BTY8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scfd2Q8BTY8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scfd2Q8BTY8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms