Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRN9

Cc2d1b, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d1bQ8BRN9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cc2d1bQ8BRN9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cc2d1bQ8BRN9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cc2d1bQ8BRN9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms