Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
E130116L18RikQ8BMV6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E130116L18RikQ8BMV6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E130116L18RikQ8BMV6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E130116L18RikQ8BMV6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E130116L18RikQ8BMV6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E130116L18RikQ8BMV6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms