Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c4Q8BMQ2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c4Q8BMQ2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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