Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo38Q8BMI0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo38Q8BMI0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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