Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc2Q8BKV1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc2Q8BKV1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms