Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK84

Dupd1, Dual specificity phosphatase DUPD1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dupd1Q8BK84 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dupd1Q8BK84 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dupd1Q8BK84 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dupd1Q8BK84 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms