Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rufy1Q8BIJ7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rufy1Q8BIJ7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms