Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIG4

Fbxo28, F-box only protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo28Q8BIG4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fbxo28Q8BIG4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fbxo28Q8BIG4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fbxo28Q8BIG4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms