Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ9

Slu7, Pre-mRNA-splicing factor SLU7, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slu7Q8BHJ9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slu7Q8BHJ9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slu7Q8BHJ9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slu7Q8BHJ9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms