Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Timm29Q8BGX2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Timm29Q8BGX2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Timm29Q8BGX2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Timm29Q8BGX2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Timm29Q8BGX2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Timm29Q8BGX2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Timm29Q8BGX2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Timm29Q8BGX2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Timm29Q8BGX2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Timm29Q8BGX2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Timm29Q8BGX2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Timm29Q8BGX2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Timm29Q8BGX2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Timm29Q8BGX2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Timm29Q8BGX2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Timm29Q8BGX2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Timm29Q8BGX2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Timm29Q8BGX2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Timm29Q8BGX2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Timm29Q8BGX2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Timm29Q8BGX2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Timm29Q8BGX2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Timm29Q8BGX2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Timm29Q8BGX2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.7 ms