Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Best2Q8BGM5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms