Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Amigo1Q80ZD8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Amigo1Q80ZD8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Amigo1Q80ZD8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Amigo1Q80ZD8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Amigo1Q80ZD8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Amigo1Q80ZD8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Amigo1Q80ZD8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Amigo1Q80ZD8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Amigo1Q80ZD8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Amigo1Q80ZD8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Amigo1Q80ZD8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Amigo1Q80ZD8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Amigo1Q80ZD8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Amigo1Q80ZD8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Amigo1Q80ZD8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Amigo1Q80ZD8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Amigo1Q80ZD8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Amigo1Q80ZD8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Amigo1Q80ZD8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Amigo1Q80ZD8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Amigo1Q80ZD8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Amigo1Q80ZD8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Amigo1Q80ZD8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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