Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WhrnQ80VW5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms