Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ell3Q80VR2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ell3Q80VR2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms