Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2eQ80UW8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Polr2eQ80UW8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr2eQ80UW8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms