Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sestd1Q80UK0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sestd1Q80UK0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms