Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Cep170bQ80U49 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cep170bQ80U49 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Cep170bQ80U49 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Cep170bQ80U49 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cep170bQ80U49 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cep170bQ80U49 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cep170bQ80U49 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cep170bQ80U49 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cep170bQ80U49 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cep170bQ80U49 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cep170bQ80U49 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cep170bQ80U49 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cep170bQ80U49 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cep170bQ80U49 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cep170bQ80U49 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cep170bQ80U49 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cep170bQ80U49 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cep170bQ80U49 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cep170bQ80U49 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cep170bQ80U49 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cep170bQ80U49 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cep170bQ80U49 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cep170bQ80U49 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 731.2 ms