Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pja2Q80U04 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pja2Q80U04 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pja2Q80U04 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms