Protein–RNA interactions for Protein: Q80TQ2

Cyld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, mousemouse

Predictions only

Length 952 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CyldQ80TQ2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CyldQ80TQ2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CyldQ80TQ2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CyldQ80TQ2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms