Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Klhl29Q80T74 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhl29Q80T74 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl29Q80T74 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms