Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Actn1Q7TPR4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actn1Q7TPR4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms